Depuis le 1er janvier 2017, Grand Annecy est administré par un Conseil communautaire composé de 93 conseillers issus des Conseils municipaux des 34 communes membres.
Ce conseil prend les grandes décisions qui engagent l'agglomération et vote les budgets. Il a désigné en son sein le PRÉSIDENT du Grand Annecy et les VICE-PRÉSIDENTS (au nombre de 15).
Son Bureau est dirigé par le Président. Cette instance participe à la mise en œuvre des projets votés lors du Conseil communautaire comme l'attribution de marchés et/ou le vote de subventions, et assure la gestion courante des affaires.
